Ученые из Академгородка открыли новое семейство белков
Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН при исследовании хронических заболеваний кишечника обнаружили гены, кодирующие новое семейство белков бактериофагов – вирусов, поражающих бактерии и регулирующие микробиоту в организме. Изучение их структуры и особенностей размножения позволит нормализовать микрофлору желудочно-кишечного тракта пациентов, сообщает издание «Наука в Сибири».
Новое семейство белков выявили при изучении возможности лечения пациентов с язвенным колитом с помощью стерильной фекотрансплантации, то есть доставки компонентов кишечной микрофлоры от здорового человека.
Ученые из Академгородка исследовали образцы кишечной микробиоты, полученные от пациентов с язвенным колитом и доноров без кишечных патологий. Основной интерес вызвали бактериофаги, содержащие системы для адаптации вируса к изменениям на поверхности бактерий-хозяев и способные обнаруживать бактерии даже после попытки ускользнуть от бактериофага.
«С помощью биоинформатических методов – поиска по гомологии (сопоставления частей биологических объектов на основе общности происхождения), а также моделирования пространственной структуры с помощью нейросети ученые исследовали обнаруженные гены-мишени бактериофагов и белки, которые кодируются этими генами. Белки получили название тентаклины», – сказано в сообщении.
Исследователи предполагают, что тентаклины используются фагами, чтобы узнавать бактерию-хозяина. Согласно другой гипотезе, бактериофаги используют эти белки, чтобы взаимодействовать с эпителием кишечника и удерживаться в кишечнике, несмотря на постоянное движение биомассы. Возможно, с помощью тентаклинов вирусы бактерий взаимодействуют с иммунными клетками организма, регулируя взаимоотношения между бактериями, населяющими кишечник, и иммунной системой.Photo by form PxHere